Dondurulur ama çözüldüğünde eski hâline dönmez. Donma sırasında oluşan buz kristalleri yoğurdun protein ağını parçalar; çözülen yoğurt suyunu bırakır ve dokusu taneli olur. Bu yüzden dondurulmuş yoğurt kaşıkla yenmez, ama smoothie, hamur işi, marinat ve pişecek yemeklerde sorunsuz kullanılır. Tam yağlı ve süzme yoğurt, az yağlı olana göre daha iyi dayanır.
Yoğurdun kıvamı, süt proteinlerinin kurduğu ince bir ağdan gelir; suyun büyük bölümü bu ağın içinde tutulur. Donma sırasında su buz kristallerine dönüşür ve genişler; kristaller ağı içeriden parçalar. Çözülme başladığında ağ eski hâline dönemez ve tuttuğu suyu geri alamaz. Kaptan çıkan şey bu yüzden pürüzsüz bir yoğurt değil, üstünde su birikmiş taneli bir karışımdır. Bu yüzden kutu dondurucudan çıktığında karıştırmadan önce beklenmesi de bir şey değiştirmez. Bu yüzden yoğurt, dondurulmadan önce ne için kullanılacağı bilinerek ayrılır.
Bu değişim bir bozulma değildir; yoğurt güvenlidir, yalnız dokusu bozulmuştur. Buradan pratik bir ayrım çıkar: doku önemliyse dondurulmuş yoğurt kullanılmaz, doku zaten değişecekse rahatlıkla kullanılır. Kaşıkla yenecek bir kâse yoğurt ya da cacık gibi bir meze için uygun değildir. Buna karşılık smoothie, kek, poğaça, marinat ve pişirilecek yoğurtlu yemeklerde fark edilmez. Aynı ayrım krema ve kaymak için de geçerlidir; ikisi de donma sonrası ayrışır.
Hangi yoğurdun dondurulduğu da sonucu değiştirir. Tam yağlı yoğurt, yağ damlacıkları yapıyı bir ölçüde koruduğu için daha iyi dayanır. Süzme yoğurt da avantajlıdır, çünkü içindeki su oranı zaten düşüktür ve daha az kristal oluşur. Az yağlı ve sulu yoğurtlar en kötü sonucu verir; çözüldüklerinde neredeyse ikiye ayrılır ve karıştırmakla toparlanmazlar. Bu yüzden dondurulacak yoğurt varsa baştan tam yağlısı alınır ya da yoğurt önce süzülür.
Paketleme ve çözdürme düzeni basittir. Yoğurt porsiyonlara ayrılır; küçük kaplara ya da buz kalıplarına dökülüp dondurulur, sonra poşete alınır. Kap ağzına kadar doldurulmaz, çünkü donarken hacim artar. Çözdürme buzdolabında ve yavaş yapılır; tezgâhta çözdürülen yoğurt daha çok su bırakır. Çözülen yoğurt tel çırpıcıyla ya da blenderla karıştırılırsa doku kısmen toparlanır. Buz kalıbında dondurulan yoğurt küpleri smoothie için özellikle pratiktir. Poşetler yassı doldurulup dik dizilirse dondurucuda çok daha az yer kaplar.
Bir sınır da bilinir: dondurulmuş yoğurt maya olarak kullanılmaz. Donma, yoğurdun kültüründeki bakterilerin bir bölümünün canlılığını yitirmesine yol açar; o yoğurtla mayalanan süt geç tutar ya da hiç tutmaz. Maya için her zaman taze bir yoğurt ayrılır. Dondurucuda üç ay dolayında iyi kalitede durur; sonrasında kullanılabilir ama dokusu daha da geriler. Dondurucuda bekleyen yoğurt kutusunun üstüne tarih yazılırsa sıra takip edilebilir.